答案：A。

　　解析：

　　A项正确，“夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。”因此，甲可以向法院提起离婚之诉。

　　B项错误，“一方患有重大疾病的，应当在结婚登记前如实告知另一方;不如实告知的，另一方可以向人民法院请求撤销婚姻。请求撤销婚姻的，应当自知道或者应当知道撤销事由之日起一年内提出。”本题中，甲在知道撤销婚姻事由两年后才提出解除婚姻关系，因超过“一年”时限已不符合申请法院撤销婚姻的情形。

　　C项错误，有下列情形之一的，婚姻无效：(一)重婚;(二)有禁止结婚的亲属关系;(三)未到法定婚龄。

　　D项错误，撤销婚姻应当向人民法院申请，而非婚姻登记部门。