事业单位内部劳动合同制和编制，有以下主要区别区别：

　　1，工资开支来源：正式编制人员工资由财政拨款解决，合同制人员工资由单位预算外收入中解决。

　　2，福利待遇：正式编制人员的福利待遇按政策规定及上级部门规定执行，合同制人员参照正式编人员标准执行，但实际上低很多或缺项。

　　3，正式编人员可以在事业单位之间调动，合同制人员不能。

　　4，正式编制人员可以提任副科级职务，合同制人员不可以。