解析

　　第一步，分析第一空。“不是……而是”形成对照并列，说明第一空所填内容与“简单挖掘”对应，且修饰“科学”，用来表达对考古这门学科的态度。A项“严肃”指使人感到敬畏，也指严谨、严格、认真，符合文意。B项“严谨”形容态度严肃谨慎，不胡乱说话，也指严肃谨慎、严格，符合文意。C项“严整”侧重严肃整齐(多指队伍)，纪律严明，着装整齐，修饰“科学”不恰当，排除C项。D项“严格”是指遵守或执行规定、规则十分认真、不偏离原则、不容马虎，符合文意。

　　第二步，分析第二空。修饰“科学理论和方法”。D项“严整”不符合文意，排除D项。对比A项“严谨”和B项“严肃”，两者意思虽有共通之处，但“严谨”侧重做事的方式方法和态度，“严肃”侧重对待事物的态度，即认真程度。修饰“科学理论和方法”，“严谨”更符合文意，排除B项。

　　因此，选择A选项。