编制层级不同，乡镇事业单位不能使用县区事业编制，县区事业单位也不能使用乡镇事业编制，之间存在层级差异，不能调剂使用;在待遇方面乡镇事业单位相比县级事业单位多了乡镇津贴;工作强度上乡镇事业单位相对大，县级事业单位相对稳定。